细菌性阴道炎的治疗主要选择抗厌氧菌的药物，有甲硝唑和克林霉素。其中甲硝唑抑制厌氧菌生长，而不影响乳酸杆菌的生长，是比较理想的治疗药物。具体用法包括口服用药，甲硝唑和克林霉素疗程均为七天左右，也可以应用甲硝唑泡腾片或者克林霉素的乳膏局部涂抹，疗程也为七天左右。性伴侣不需要进行常规的治疗，治疗以后多数患者一周左右症状消失，并且不需要进行随访。
细菌性阴道炎主要是由于阴道内的菌群紊乱，导致阴道内产生过氧化氢的乳酸杆菌减少，而其他的微生物大量繁殖，主要是以加德纳菌等厌氧菌为主。所以患者主要表现为阴道分泌物增多，有鱼腥臭味，伴有轻度的外阴瘙痒和烧灼感。如果细菌性阴道炎不经过治疗，可以导致女性感染子宫内膜炎、盆腔炎等，对于妊娠的女性，容易导致绒毛膜羊膜炎、胎膜早破、早产等风险。所以，建议细菌性阴道炎患者积极行药物治疗，使用一周左右，症状可以缓解。