滤泡性淋巴瘤的病因，目前还不是很明确，发生可能和病毒感染有一定的关系，当病毒感染人体后会使人的免疫功能低下，引起滤泡性淋巴瘤的发生，免疫功能的异常，尤其是免疫功能低下、免疫缺陷病也会并发滤泡性淋巴瘤。
某些获得性的免疫缺陷病，同样可以伴发滤泡性淋巴瘤的发生，滤泡性淋巴瘤的出现，还和遗传上基因的改变具有一定的关系，当出现染色体易位、数目异常或染色体上某些基因的缺失，就会导致滤泡性淋巴瘤的发生。
除此以外，放射性、化学性的接触和淋巴结的非特异性反应性增生，也会引起滤泡性淋巴瘤。