当早晨起床时发生口臭，最可能的原因是由于夜间没有刷牙所引起，或者刷牙没有刷干净，牙缝间有食物残渣残留。正常情况下，口腔内存在着多量细菌，细菌发酵食物残渣，会产生特殊臭味的气体，所以会引起口臭。
另外，夜间睡眠时，各项生理机能都减退，唾液腺的分泌功能也减少，唾液减少，冲刷和清洗、转运作用减弱，也会引起口腔内的臭味。早晨起床口臭，也与夜间喝水少有关系。当发生早晨起床口臭应综合的分析原因，尽量做到睡前一定要认真地刷牙，学会正确的刷牙方法，必要时配合牙线和间隙刷，半年进行一次洁治，去除口腔内的结石。夜间不要吃完饭就睡觉，要进行适度的体育锻炼，保证自己的胃肠消化功能正常，正常情况下，口臭的现象就会逐渐的减少。