全飞秒激光手术治疗近视，会损失部分角膜前基质层内的神经，但是随着时间的推移，大部分人可以恢复正常。全飞秒激光手术是完全利用飞秒激光完成的手术，手术在角膜层间进行两次扫描，形成一枚透镜，然后通过微切口将透镜取出，从而完成手术。部分患者在术后早期可能伴随眼睛的干涩症状，可能是患了干眼症，因为全飞秒激光手术会切断角膜前基质层内的感觉神经丛，在术后早期会导致角膜知觉的减退，从而导致瞬目反射减少，从而导致基础分泌泪液减少，泪液减少在早期可以引起干眼症，但是大部分人可以恢复正常。
全飞秒手术虽然可以切断部分角膜前基质层内的神经丛，但是相对于半飞秒手术或者准分子激光手术而言，其对角膜生物力学的改变相对较小，而且对角膜神经的破坏较少，术后发生干眼症的概率也较低。