胃镜检查的危害主要包括有以下方面：
1、反射性呕吐，因为在接受胃镜检查的过程中，医务人员需要使用纤细内窥镜经过口腔、会厌、食管等部位进入到胃部内部检查，会厌软骨在受到外界物质的刺激作用下，较为容易出现有恶心、呕吐、咽喉肿痛等不良症状反应发生，部分受检者此类不良症状表现可能会持续有数天的情况。
2、上消化道黏膜损伤，在胃镜检查过程中，受检者若出现有较为剧烈的不良症状反应，不仅会影响检查结果的准确性，甚至会增强医务人员出现操作失当的风险，从而引起食管、贲门等局部黏膜组织出现受损情况。
但是此类损伤一般较为轻微，通过适度护理措施即可快速恢复，如清淡饮食、充足休息、多补充水分等。