肝门息肉老是掉出肛门外，通常需要手术治疗并且送术后病理检查，排除恶变可能。如果证实有恶变时，甚至需要加做肠癌根治，并配合术后化疗、放疗等综合治疗。
因为肛门处的息肉通常是良性疾病，但是长期息肉刺激有恶变的可能。对于直肠肛管息肉，目前在临床上保守治疗无效，唯有通过手术切除才能获得治愈，手术切除以后息肉需要送病理检查，排除恶变的可能。如果证实为恶变，也就是直肠癌或肛管癌，此时通常需要进一步加做肠癌根治切除，并配合术后化疗、放疗等综合治疗，甚至分子靶向药物治疗，才有可能获得治愈。