通过鼠传染的疾病有很多，大约有几十种，对人类健康威胁最大的是鼠疫和流行性出血热。鼠疫传染性非常强，可以通过鼠、蚤叮咬传播，也可以通过直接接触患者的体液或者是病兽而传染，主要的临床表现是发热、淋巴结肿大、肺炎，以及出血倾向等。
鼠疫是我国法定的甲类管理传染病，历史上鼠疫也是导致高死亡率的大流行病，在14世纪时被称为黑死病，曾在欧洲造成约5000万人死亡。流行性出血热可以通过被鼠咬伤，或者是破损的伤口接触带病毒的鼠类排泄物、血液后，感染了汉坦病毒而发病，还有通过呼吸道、消化道，以及虫媒、气溶胶等传播，主要的临床症状是发热、出血、休克，还有以肾损害为主的表现。