扁平苔癣的致病原因目前尚未清楚，考虑可能与以下几个方面有一定关系：
第一、遗传因素；
第二、免疫紊乱因素，可能由于患有甲状腺功能减退或者亢进等免疫紊乱性疾病，而导致自身出现破坏自身组织的抗体，而引起了扁平苔藓的发生；
第三、病毒感染，主要是由于乙肝病毒或者丙型肝炎病毒感染，而造成扁平苔藓的发生；
第四、日光紫外线的强烈照射也可以导致扁平苔藓的出现。
在上述原因造成扁平苔藓后需要避免其诱发因素，减少其发病几率。