贲门腺癌病人最佳的治疗方法是进行根治性的手术切除，在手术切除了贲门腺癌之后可以根据术后病理的回报结果，采用术后的辅助化疗来清除体内可能存在的残余癌细胞。
如果病人已经不适于进行手术治疗，可以采用全身化疗联合局部放疗的手段来控制病情的进展，提高病人的生活质量，延长病人的生存时间。如果免疫组化结果显示HER2基因阳性，在化疗的同时还可以采用抗HER2基因的靶向药物来进行治疗。总的来说，要想提高贲门腺癌病人的治愈机会，早期发现、早期诊断、早期给予积极的治疗是最好的手段。