卵巢囊肿5cm是否严重，要根据卵巢囊肿的性质来决定。卵巢囊肿根据性质不同，可以分为卵巢生理性囊肿、卵巢子宫内膜异位囊肿，也就是卵巢巧克力囊肿，以及卵巢炎性囊肿，还包括卵巢上皮性囊肿，比如卵巢浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等等。5cm的卵巢囊肿要看是什么性质，如果是卵巢生理性囊肿，只是在月经后半期出现的附件区的无回声区，可以经过2-3个周期的观察。如果经过2-3个月之后，在月经刚刚结束时进行超声复查，囊肿缩小甚至消失，这种情况就可以认为是卵巢生理性囊肿。它是不严重的，也不需要进行治疗。如果卵巢子宫内膜异位囊肿合并有严重的痛经，或者女性出现了不孕症的临床表现，这种情况是需要进行积极治疗的，否则病情加重会影响女性的生育功能。如果是卵巢的炎性肿物，如果不进行积极的抗炎治疗，也会导致反复的盆腔炎发作以及女性不孕症的发生。