脑部的核磁共振检查是脑部疾病常用的一种检查方式，它可以诊断出绝大部分的脑部疾病，比如各种脑部的先天性发育异常、脑部的占位性病变，比如肿瘤、脓肿、寄生虫病等，还包括脑血管性的病变，比如脑梗塞、脑出血、蛛网膜下腔出血、先天性的动静脉发育畸形等。
此外，核磁共振还可以诊断脑白质病，总之，脑部核磁共振检查是脑部疾病非常重要的一种影像学检查方式，它可以比CT获得更重要的脑部组织的信息，所以通常一些比较复杂的疾病都会选择脑部核磁共振检查。