新生儿黄疸肝功能异常可能存在，孩子肝功能异常本身和新生儿黄疸没有关系，或者说新生儿黄疸本身不会引起孩子肝功能异常。但是某些原发病可能会导致孩子同时存在新生儿黄疸和肝功能异常，比如常说的婴儿肝炎综合征，往往是和病毒感染有关，如口腔巨细胞病毒感染等。这个时候孩子往往就会有明显的肝损的表现，也就是抽血检查会发现孩子肝功能异常，同时孩子也会有黄疸的表现，也就是孩子血里胆红素水平的增高，所以孩子黄疸和肝功能的异常都是孩子巨细胞病毒感染，或者新生肝炎的相关的症状、表现，这种情况比较常见。
如果孩子有感染或者其他的某些疾病，也可能会导致孩子同时出现黄疸和肝功能异常，所以需要具体对孩子进行相关的实验室检查，和必要的影像学检查，帮助来判断引起孩子黄疸和肝损的原发病到底是什么，然后再做相应的对因和对症治疗。