乙型肝炎转氨酶升高，可以应用保肝药物，如甘草酸制剂、水飞蓟等，或者中药饮片也具有保肝的作用。如果转氨酶升高且伴有乙型肝炎病毒HBV-DNA也同样升高时，应该积极抗病毒治疗，此时应该是乙型肝炎的免疫清除期，应用抗病毒治疗效果会更好。
对于乙型肝炎，只要是符合抗病毒条件时，应该积极的进行抗病毒治疗。目前抗病毒的药物主要是干扰素、恩替卡韦和替诺福韦。应用干扰素时会有一定的副作用，如发热、流感样症候群以及骨髓抑制症状。应用替诺福韦时，应该观察肾毒性反应。