肾错构瘤是否影响肾功能，主要跟肾错构瘤的大小有关，还跟肾错构瘤所处的位置有关。一般来讲，肾错构瘤小于4cm，对肾脏功能影响不大，可以定期的随访观察。
如果肾错构瘤的直径大于4cm以上，需要进行手术处理，可以行腹腔镜下肾部分切除摘除肿瘤。另外，还跟肾错构瘤在肾脏上所处的位置有关，如果肾错构瘤位置正好位于肾盂或肾门处水平，有时对肾盂或输尿管造成压迫，也会引起肾功能影响。