如果宝宝确诊为支原体支气管炎时，可根据病情使用大环内酯类的阿奇霉素、红霉素、罗红霉素等相关的药物进行治疗。病情轻时可口服给药，病情重时需要静脉给药，并根据病情的严重程度决定用药的时间。
同时，要根据临床症状给予对症的治疗，例如宝宝出现发热时，可根据体温给予物理降温或者是药物退热。当宝宝出现咳嗽，影响休息和睡眠时，可口服止咳的药物，例如肺力咳合剂等等，确诊为支原体支气管炎的宝宝，要注意休息并避免受凉。