大蒜素属于天然来源的抗感染药物，用于深度真菌和细菌感染，比如肺部和消化道的真菌感染、白色念珠菌菌血症、急慢性菌痢、肠炎、百日咳以及隐球菌性脑膜炎、肺结核等。对于多种革兰氏是阳性和阴性菌都有抗菌作用，也可以抗结核杆菌，大蒜素能够帮助清除活性氧自由基，抑制脂质过氧化等，对于炎症还有抵抗作用，同时还能延缓衰老，预防癌症的发生，在口服给药的时候，由于大蒜素对胃有刺激性，而且容易被胃液破坏，所以口服胶囊制剂应该整粒吞服，不能够咬破或者嚼碎了再服用，同时考虑到药物的刺激性，这个药物不适合皮下或者肌肉注射、静脉滴注。
大蒜素可以导致血管刺激症状，也可以导致全身灼热、出汗，点滴的部位会发生刺痛，需要注意的是大蒜素不推荐常规使用，仅仅在其他抗感染药物无效或者不耐受的情况下选择性使用，尤其是对特异体质的人群，对几乎所有的抗感染药物都过敏或者不耐受，这样的人群可以选择使用大蒜素。