左向右分流型先天性心脏病最常见的并发症，包括感染性心肌或心内膜病变。左向右分流型先天性心脏病往往包括房间隔缺损、室间隔缺损，以及动脉导管未闭等疾病。
先天性心脏病的患者心脏解剖结构的变异，往往造成血流动力学紊乱，而并发感染性心内膜炎、心肌炎等情况，容易加重或诱发心力衰竭。另外，可出现异常的血栓情况，而造成脑血管意外。左向右分流型先天性心脏病的部分患者可自愈，建议对于患者进行动态观察。如果患者的缺损不能自愈，则需要尽早手术治疗，解除解剖学变异而改善患者的预后。