目前专门治疗食管癌的靶向药很少，特别是治疗食管鳞癌的靶向药物目前几乎没有。对于食管腺癌或者食管胃结合部腺癌，有的研究证实吉非替尼或者厄洛替尼可能有效，但是这些研究中的病例数都不是很多，目前具体的疗效还不是很确切。如果是HER-2强阳性的食管胃结合部腺癌，应用曲妥珠单抗联合化疗跟单纯的化疗相比会明显改善生存时间。曲妥珠单抗联合化疗之后还需要继续使用曲妥珠单抗，一直到疾病进展为止。曲妥珠单抗这种靶向药物应用在HER-2强阳性的食管胃结合部腺癌上，疗效比较确切。