更昔洛韦胶囊的有效成分是更昔洛韦，更昔洛韦和阿昔洛韦同属于鸟嘌呤核苷的类似物，都属于抗病毒药物。但不同的分子结构，造成对不同病毒的敏感度不同。
更昔洛韦对于巨噬细胞病毒感染敏感，阿昔洛韦对于单纯的疱疹病毒感染敏感。更昔洛韦胶囊适用于免疫损伤，引起的巨细胞病毒感染的患者，可以治疗免疫功能损伤，发生的巨细胞病毒性视网膜炎的维持治疗，预防可能发生于器官移植者的巨细胞病毒感染、预防晚期艾滋病感染者的巨细胞病毒感染。阿昔洛韦主要用于单纯性疱疹病毒所致的各种感染，治疗中对这两个药使用，需要严加区别。