肺脓肿治好后空洞会消失，肺脓肿确诊后首先要使用有效的抗生素进行治疗，使用的抗生素要覆盖厌氧菌，例如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等等。
同时也可以根据痰培养、药敏试验的结果更换抗生素，要注意痰液引流，包括体位引流和使用祛痰的药物。临床上常用的祛痰药物包括氨溴索、桉柠蒎肠溶软胶囊、乙酰半胱氨酸等等。
经过上述治疗效果比较差时，还可以选择支气管镜介入治疗，可以局部给药也可以进一步促进痰液引流，上述治疗方法均无效时可根据病情，有手术指征可考虑手术治疗。