怀孕40天有阴道分泌物，需要根据分泌物的颜色、性状等综合判断是否正常。在怀孕早期，由于体内雌激素和孕激素发生变化，可导致阴道分泌物增多，颜色呈现白色或乳白色，黏稠状，是正常的情况。
如果出现鲜红色或者褐色分泌物，提示存在宫腔内出血的可能，有可能因为体内激素水平不足，或者胚胎发育异常引起流产先兆，需要及时去医院查找病因，根据具体情况保胎治疗。
如果出现黄色或者黄绿色分泌物，同时伴有外阴以及阴道瘙痒的症状，考虑存在病原菌感染的可能。需要去医院做阴道分泌物常规检查，根据检查的情况，在医生指导下选用相对安全的药物治疗，以免危及宫内胚胎的安全。