复方黄连素是口服药品，成分主要是小檗碱，其实黄连素就是小檗碱。复方是加了其它的成分，比如木香、白芍，主要功效是清热、燥湿行气、止痛、止痢、止泻，所以可以用于治疗大肠湿热、赤白下痢、里急后重或者暴注下泻等等症状，比如肠炎的痢疾有上述症状时，也有一定的疗效。
这些适应症都是现在中医里的描述，所以建议患者在使用之前咨询一下中药师、中医师，在中医理论指导、规范诊疗下，选择和使用这个药物。另外，复方黄连素是辅助治疗的作用，如果短时间使用后症状没有缓解或者症状加重，一定要复诊，再次找医生或者药师来换药或者接受其它规范的治疗。