肛门局部脓肿一般是属于肛周脓肿，肛周脓肿发生以后需要尽快进行手术治疗，因为，如果不手术的话，很有可能会导致局部脓腔进一步扩大或者感染加重，从而加重病情和延误病情，对之后的治疗以及手术加大了难度，也延长了患者的恢复时间，所以肛周脓肿发生以后，早期一定要进行相应的消炎以及手术治疗。
早期患者会有明显的局部红、肿、热、痛，等待肛周脓肿成脓以后需要尽快将局部的脓液切开、引流，排出干净，并且进行局部伤口创面的一次性根治手术。伴随有局部肛瘘形成的，还需要配合肛瘘切开挂线疗法，对局部的括约肌功能保护的情况下，尽量将感染灶祛除干净，术后注意局部伤口的肉芽生长情况，避免过度增生而导致假性愈合。