16岁患者服用避孕药不会导致不孕不育，因为避孕药可以起到调经作用。如果16岁患者月经不规律，如多囊卵巢综合征，服用避孕药可使月经规律，只要不漏服，不会导致不孕不育。如果有过早性生活，可采取避孕药的方式避孕。
如果以后有生育打算，可停止服用避孕药。如果是多囊卵巢综合征或月经不调，患者担心药物的影响，可咨询医生服用一段时间后，观察月经是否正常，再根据具体情况对症治疗。