判断是不是肛门疣最简单的办法就是直视下观察疣的形状，一般呈扁平，而且不是很大，而且也没有明显的临床症状。如果有局部的瘙痒不适，而且生长迅速，这可能是性传播疾病，比如尖锐湿疣，或者是带状疱疹等都有可能。
如果是简单的肛门疣，一般不会有明显的快速生长，也没有明显的临床症状。当然必要时还可以取病理化验，进一步明确诊断，如果明确诊断是肛门疣，一般建议积极的抗病毒对症支持治疗。如果是尖锐湿疣，一般建议还是激光治疗的同时给予积极的抗病毒对症治疗。
如果发现了肛门有肿物，分辨不清是肛门疣还是其他的疾病，建议还是到正规的专科医院，找专业的医生就诊咨询。