男性检查HPV病毒要以细胞学检查为主，具体检查病变部位脱落细胞。
因为HPV病毒属于生殖器传染性疾病，所以主要检查的细胞是生殖器部位细胞，男性检查HPV病毒有一定难度，不像女性可以直接检查宫颈细胞，男性生殖器周围细胞不容易脱落，在细胞提取时有一点难度，如果细胞检查表明病毒呈阴性说明没有被病毒感染，如果检查结果阳性表明受到感染。
细胞学检查准确率非常高，属于DNA检测的一种。HPV病毒进入人体以后会有一段时间潜伏期，但是在这期间男性也容易出现生殖器周围尖锐湿疹的状况，有过这种情况的男性可以考虑做HPV病毒检查。