对于大三阳的患者多考虑是患者抽血查乙肝三系统，提示患者乙肝表面抗原为阳性、乙肝E抗原为阳性以及乙肝核心抗体阳性，此三者为阳性称为大三阳。
大三阳的患者多考虑有病毒的复制，如果此时患者抽血查乙肝DNA提示患者病毒有复制，而且复制的量较高，多考虑患者此时处于病毒复制的窗口期。如果合并有谷丙、谷草转氨酶的升高，此时建议患者积极的予以抗病毒治疗。
患者如果是初次治疗，可以选择拉米夫定进行积极的抗病毒治疗。但是对于病毒部分复制的患者，或者之前服用过抗病毒的药物，但是服用不规则，已经自行停药，可以考虑口服恩替卡韦等药物进行积极的抗病毒治疗。
另外，患者还可以考虑注射干扰素进行抗病毒的治疗，干扰素的注射需要维持半年到一年左右，患者的病毒复制多可得到控制。对于口服药物的患者，如果合并有肝硬化的情况，患者不能自行停药，需要终身服药。