婴儿甲减出现的临床症状主要包括智能落后、生长发育迟缓和生理功能低。
患儿常为过期产且出生体重超过正常，常有腹胀、便秘、脐疝等消化道症状，容易被误诊为先天性巨结肠，生理性黄疸也会出现延长。
患儿常处于睡眠的状态，对外界反应低下，也会出现肌张力低、吸奶差、呼吸慢、哭声低且少，常常会出现智能低下、眼睑浮肿、面部黏液性水肿、皮肤粗糙、面色苍黄、毛发稀疏、身材矮小等病状。