尖锐湿疣的治疗方法特别多，最好的方法要根据感染尖锐湿疣的疣体形态、大小、多少、部位而定。如果是单纯性尖锐湿疣，单发疣体比较孤立，最好治疗方法是局部打麻药，然后用微波或激光烧掉。
如果疣体面积多且泛发成片，最好遵医嘱用外用药水，如25%的竹叶草脂涂剂、鬼臼毒素酊或咪喹莫特乳膏，效果比较好，如果反复发作的话，还需要配合口服抗病毒药和提高免疫力的药物治疗。所以尖锐湿疣治疗的最好方法未必是一种治疗方法，每种治疗方法都是有优势的，要根据不同的情况做选择。