如果有慢性咽炎可以做胃镜检查，如果急性咽炎发作，暂时停止做胃镜检查，可以治疗急性咽炎，急性咽炎经过一周的治疗，可以控制症状，咽炎症状控制以后可以做胃镜检查。
在咽炎的急性发作期，如果做胃镜检查容易刺激咽腔黏膜，加重咽炎的症状。在慢性病咽炎时可以做胃镜检查。
但是做完胃镜检查以后，如果出现咽部不适感，咽疼、咽干、咽痒，需要用药物治疗、雾化吸入、口含片。如果出现咽疼难忍，需要口服抗生素联合治疗，可以有效控制症状。