疱疹性咽峡炎主要发生于1-7岁的儿童，成人也可发病，该病起病急，多为高热可达39-40℃，在咽峡部、软腭、悬雍垂以及扁桃体等部位，可见10多个较小并聚集的小疱疹，1-2天疱疹溃破后形成溃疡，无身体其他部位溃疡存在，无全身严重并发症发生。而手足口病发生于5岁以内的幼儿，一般无高热，体温不超过38.5℃，精神状态差，在口腔颊部、舌部、唇部牙龈或硬腭部位可见散在疱疹，并可在手心、足心、臀部等部位可见到疱疹，可发生严重的并发症，如脑膜炎、脑炎、肺水肿以及循环衰竭而死亡。疱疹性咽峡炎和手足口病，都是由肠道病毒感染，引起的急性上呼吸道传染病，由于预后不同，需注意鉴别。