肾结核的诊断有时候需要做肾脏增强CT来进行确认，因为肾结核在临床上的影像学表现往往是没有特异性的。如果发现了肾脏结核，要结合尿液的检测、血液的检测以及影像学的检测来进行鉴别诊断，有时候病史也很重要。因为肾结核是往往继发于机体其他部位的结核，而造成肾脏的感染，最常见的就是肺结核。
肺结核处于活动期，结核杆菌就会随着血液进入到肾脏发生肾脏结核。肾脏结核如果怀疑存在的时候要做相应的肾脏强化CT来确认，以和其他的肾脏疾病来进行鉴别诊断。因为不同的疾病有不同的治疗方案及预后，如果是肾脏结核，应用抗结核药物以后经过6-9个月或者更长的时间有可能完全治好。如果是肾脏其他的疾病，例如结石或者肿瘤，它的预后和结核是完全不同的。