肠道菌群失失调是当人体抵抗力降低或者长期大量的使用广谱的抗生素以及激素时，使正常的菌群被抑制，而非正常的菌群过度的繁殖而导致的一个失衡，治疗的原则要严格掌握抗生素以及糖皮质激素的适应症，切勿滥用。在抗生素的使用过程中，做大便的细菌学检查。也就是细菌培养，然后监测大便中菌群的变迁。一旦出现异常的细菌组合，及时停用抗生素，根据大便的培养以及药敏试验，选用敏感的抗菌素；也可以采用正常人的灌肠治疗，还有服用乳酸杆菌制剂。