尖锐湿疣可以长在肛门里面，尖锐湿疣主要在外生殖器及肛门周围皮肤黏膜湿润区域，男性一般发生在龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎部和会阴，女性一般发生在大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛周。同性恋人群发生在肛门及直肠内，少数患者可以发生在肛门生殖器外的部位，例如口腔、腋窝、乳房和趾缝等。
皮损初期是单个、多个或成群的淡红色小颗粒，质地柔软，顶端稍尖锐，有时候很小，以至于用眼无法辨别。皮损后期可以逐渐增多、增大，形态可以为乳头状、菜花状、鸡冠状，颜色为白色、粉红色或者乌黑色，表面可以出现糜烂、渗液、破溃、出血或感染。