宫颈纳氏囊肿是慢性宫颈炎的一种，未发生过性生活的女生出现宫颈纳囊，也是由于宫颈炎症长期刺激引起的。女性外阴与阴道的细菌能够上行感染至宫颈，甚至宫腔，处女虽然无性生活史，处女膜完整，能够起到一定的保护作用。
但是，如果卫生状况不良，尿液或粪便清洁不彻底，或者免疫力低下，容易出现外阴炎及阴道炎，那么细菌就会沿着处女膜的孔洞进入到阴道内，感染宫颈，引起宫颈炎症。
炎症长期刺激会引起宫颈腺体发炎，腺管堵塞，炎性渗出液无法排出，就形成潴留囊肿。有性生活的女性可能在性生活时受到感染，所以患宫颈囊肿的几率大大增加，但这是一种良性疾病，即使处女患病也不需要紧张，可在生育后再治疗。