男性不育检查的项目包括体格检查、影像学检查和实验室检查等，体格检查包括男性生殖系统器官，比如睾丸、附睾、阴茎的发育情况，有无畸形，以及包皮过长、包茎等。
影像学检查包括阴囊的超声和泌尿系超声，通过超声可以了解睾丸、附睾、精囊、前列腺等生殖系统的器官有无异常。实验室常见的检查项目有精液检查、激素六项检查等，精液检查是男性不育的重要检查项目，通过精液检查，可以初步的判断男性的生育能力，包括精液的量、液化时间、粘稠度、酸碱度、精液中的白细胞、精子的密度、精子总数、精子的活力、精子的形态学检查和精浆的生化分析检查等。