脊索瘤的典型症状也是常见的症状，为持续性的钝痛或者全头痛。根据肿瘤发生部位的不同分为：一、鞍区的脊索瘤，主要是垂体功能引起的视野偏盲、垂体功能低下、阳痿等表现。二、鞍旁脊索瘤，可以引起动眼神经、滑车神经及外展神经的改变。三、斜坡处的脊索瘤，主要是脑干受损的症状、行走不稳及锥体束的阳性症状。四、广泛性的生长可引起脑积水等神经功能障碍。