腘窝囊肿如果不治疗有可能会引起如下的危害：
1、此类疾病有可能会导致患者持续出现膝关节后方疼痛，比如患者在步行或者是伸直膝关节的时候，都会持续出现剧烈疼痛。
2、这种疾病还有可能使患者膝关节严重活动受限，久而久之就会导致患者出现膝关节活动度下降。
3、这种病变很有可能会导致腘窝内部的其他结构受到严重压迫，比如在腘窝内部的动脉或者是静脉长期受压，就容易产生下肢血液供应不足、血液回流不好甚至是引起血栓形成，就会导致患者长时间出现膝关节以下部位的发冷、疼痛、麻木、无力之类的症状。
4、患有此类疾病的患者，在发病期间很有可能会持续性加剧，并且容易并发膝关节内部的其他炎症，比如此类患者非常容易并发膝关节的骨性关节炎、风湿或类风湿性关节炎，而且此类患者还容易出现膝关节感染。