尿路感染和妇科炎症最好同时进行治疗，因为两者治疗并不矛盾。尿路感染治疗一般为口服抗菌药物，常用的有左氧氟沙星、头孢地尼、磷霉素、莫西沙星、阿奇霉素等广谱抗生素。如果出现上尿路感染、发热、腰痛等全身症状，也可以选择静脉使用抗生素。妇科炎症通常以外用药物为主，比如栓剂和洗剂。
所以，两者并不矛盾，可以同期进行治疗，否则单纯治疗泌尿系统感染，妇科炎症持续存在，炎性分泌物非常容易通过尿道口，重新逆行感染尿道和膀胱，造成尿路感染久治不愈或者反复感染。反过来尿路感染如果久治不愈，长期使用大剂量的抗生素，也会造成患者的阴道菌群失调，更容易患妇科炎症。因此，二者有可能会出现互为因果、恶性循环的局面，最好同期治疗。