排尿时刺痛主要考虑合并有急性泌尿系感染，主要是因为细菌从尿道口进入尿道和膀胱而引起来的局部细菌堆积，损伤了膀胱黏膜和尿道黏膜，导致尿液经过时会出现明显的尿痛症状，同时还会合并有尿频、尿急，甚至出现发热、寒战等全身炎症反应。
如果出现这种情况可以检查一下尿常规，多数会提示尿的红细胞和白细胞阳性。
另外还有一部分人可能是存在膀胱结石、输尿管下段结石以及尿道结石的可能，就会引起直接的尿道损伤和膀胱黏膜损伤，而导致尿液刺痛等症状，多数会伴有排尿费力以及腰部胀痛等不适，B超和尿常规可以明确诊断。