胃食管反流引起咽炎，主要还是要针对胃食管反流病进行治疗，咽炎方面给予对症治疗。胃食管反流病的治疗，主要针对发病机制，包括减少胃酸分泌的质子泵抑制剂、促胃肠动力药物、抗反流手术等等，分为改变生活方式、药物治疗、内镜下治疗和手术治疗，具体如下：
1、改变生活方式：要改变生活方式，避免诱发因素，如咖啡、酒精、碳酸饮料、巧克力、高脂食物，睡眠时抬高床头，避免餐后2-3h内睡、卧。
2、药物治疗：抑制胃酸，首选质子泵抑制剂，在食管炎的愈合率、愈合速度和反流症状缓解方面，质子泵抑制剂有显著效果，抗反流药物包括巴氯芬，促进胃动力药物包括多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利，黏膜保护剂包括铝碳酸镁、硫糖铝。
3、内镜下治疗和手术治疗：如果药物治疗效果差，考虑内镜下治疗或手术治疗，缓解临床症状。