亚急性细菌性心内膜炎治疗方案如下：
1、支持疗法，补充营养，增加蛋白质的摄入，注意休息，增强免疫力。
2、清除赘生物中的致病微生物，亚急性心内膜炎致病菌通常为草绿色链球菌、肠球菌、凝固酶阴性葡萄球菌或革兰氏阴性杆菌，要根据血培养的结果及药物敏感试验，来选择致病菌敏感的抗生素。
3、外科手术治疗，对于抗菌药物治疗无效，同时出现心脏并发症的心内膜炎患者，心脏外科手术至关重要，尤其是因为风湿性心脏瓣膜病、先天性心脏病伴发的亚急性心内膜炎。
4、并发症的治疗，如心力衰竭的治疗。