在甲状腺结节的诊断过程中，如肿物的性质不明确或者有恶性倾向，大多医生会建议患者进行细针穿刺，以明确肿物的性质，由于细针穿刺取出的甲状腺组织是十分细小的，穿刺以后甲状腺功能不会因此受到任何影响，当然穿刺的主要目的是明确肿物的病理诊断。
有时候如果穿刺的部位不够准确或者穿刺组织太少，对于一些病变的诊断有时是不能提供准确保证的，比如甲状腺癌位置较小，穿刺的时候没能及时的正确穿入到癌症病变之内，这时检出的病理诊断为良性病变。对于这种情况要进行持续的甲状腺影像学观察，必要的时候可以重复活检或手术切除来明确甲状腺肿物的性质。