消化不良会引起口臭，消化不良多表现为持续或间断的上腹部不适、疼痛、饱胀、烧心、嗳气等，其可以分为器质性消化不良和功能性消化不良。相关的流行病学资料显示，有50%的消化不良患者存在口臭。
消化不良者的胃肠道功能较弱，食物不易消化和排空，在胃内存留的时间就会延长，食物在细菌的作用下腐败，并释放出异味。腐败食物及其异味极易反流，异味经口腔呼出、残留于口腔，便形成了口臭。