小柴胡颗粒和藿香正气水或者藿香正气液是可以一起吃的，但是需要间隔一段时间服用才可以，通常服用顺序是先服用小柴胡颗粒，而后间隔30分钟后再应用藿香正气液。因为小柴胡颗粒通常治疗的疾病属于风热型感冒，在身体发热或者半有明显感染的时候，服用小柴胡具有明显祛风散热、清热解毒的功效。
藿香正气液可以应用于暑湿型感冒或者应用于胃肠感冒的时候，都能够通过应用藿香正气进行调整和调理，同时藿香正气也具有一定退烧的作用效果。但是藿香和柴胡如果进行配伍后会出现一定的化学反应，从而导致两种药物都会有一定继发性失效的情况出现，因此建议小柴胡和藿香正气药间隔30分钟方可服用。