接种13价疫苗时，患者出现咳嗽的副反应也比较罕见。如果咳嗽不严重，不需要特殊的治疗。如果咳嗽严重，可以给予对症止咳治疗。接种13价肺炎疫苗常见的副反应可见发热，或者是注射部位出现红斑、硬结、肿胀、疼痛，包括触痛，或者食欲下降、易激惹、嗜睡、入睡困难、腹泻、呕吐、皮疹等症状。
13价肺炎疫苗主要是针对六周龄到15月龄的婴幼儿，接种部位是肌肉注射。婴儿推荐最佳接种部位是大腿前外侧，幼儿为上臂三角肌，基础免疫是第二、四、六月龄各接种一剂，首剂最早可以在六周龄时接种，之后各剂间隔4-8周加强免疫，可以在第12-15月龄时接种一剂。