扁桃体肥大如果没有任何的症状是不需要进行治疗的，如果扁桃体肥大伴有相应的症状是需要进行治疗，比如扁桃体肥大伴有反复的炎症发作，有咽痛、发热，急性的情况下可以通过抗炎治疗，口服头孢类或者是青霉素类的抗生素，大多数是能够缓解和治愈的。
如果炎症反复的发作，每年>4-6次可以通过手术切除扁桃体进行治疗，如果扁桃体肥大伴有睡眠打鼾、呼吸暂停，也可以通过手术切除扁桃体来改善气道梗阻。扁桃体肥大影响到吞咽、影响到进食也可以通过手术来切除扁桃体。