肺结核抗结核治疗时，一般2-3周症状可以消退，传染性也可以消失。关键是要合理、规范的用药，治疗原则要遵循早期、规律、合理、适量、联合的治疗原则，在用药期间不能擅自停药。如果因故未用药，也应该采取补救措施，以保证规律用药，减少耐药性的发生。
合理、规范的用药治疗后预后较好，大多数都可以治愈。未经合理治疗，感染可能会恶化，并从肺部扩散到其它身体部位，会演变成播散性疾病，甚至可以危及生命。抗结核治疗的目的不仅是要杀菌、减少耐药的产生，最终还要追求灭菌，防止和杜绝复发。