呋喃妥因是一种抗生素，对于敏感菌引起的尿路感染治疗效果非常好，如果是对呋喃妥因耐药的致病微生物引起的尿路感染，治疗效果就没那么好。
在尿路感染选择抗生素治疗之前，还是应该要通过尿培养明确具体的致病微生物种类，和药物敏感性以后再选择抗生素，对呋喃妥因耐药的一些致病微生物引起的尿路感染，可以选择其他的抗生素治疗，比如左氧氟沙星片、阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片等，可能效果会更好。
对于支原体、衣原体感染引起的尿路感染，一般可以选择阿奇霉素片、美满霉素胶囊、克拉霉素片，治疗效果会更加的好，同时也可以选择一些清热利湿、通淋利尿的中成药，比如三金片、八正胶囊、热淋清胶囊等，也有很好的辅助治疗作用。