扁平疣做激光和冷冻治疗，都是在临床上非常常见的疗法，具体哪一种方法效果比较好，没有明确的研究结果，需要根据临床的不同情况来选择激光和冷冻。
激光是用高温直接把扁平疣疣体清除，冷冻是低温疗法使扁平疣疣体坏死、脱落，激光治疗比较快，冷冻治疗时间比较长。
激光和冷冻相比疼痛更明显，儿童扁平疣首选冷冻治疗，如果是大人可以选择激光，也可以选择冷冻。
扁平疣如果是发生在面部，做激光就容易留下色沉和疤痕，可以选择冷冻，但是冷冻也容易留下色沉。